Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms