Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ME3Q16798 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ME3Q16798 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ME3Q16798 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ME3Q16798 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ME3Q16798 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME3Q16798 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME3Q16798 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME3Q16798 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ME3Q16798 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME3Q16798 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME3Q16798 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME3Q16798 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME3Q16798 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME3Q16798 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME3Q16798 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME3Q16798 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME3Q16798 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME3Q16798 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME3Q16798 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME3Q16798 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME3Q16798 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME3Q16798 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME3Q16798 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME3Q16798 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME3Q16798 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME3Q16798 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME3Q16798 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME3Q16798 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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