Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN3Q16667 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN3Q16667 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN3Q16667 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN3Q16667 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDKN3Q16667 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
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