Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NR1D2Q14995 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
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NR1D2Q14995 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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NR1D2Q14995 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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NR1D2Q14995 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1D2Q14995 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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