Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ITGAEP38570 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGAEP38570 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms