Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAD1O00515 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAD1O00515 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAD1O00515 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAD1O00515 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAD1O00515 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAD1O00515 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAD1O00515 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAD1O00515 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAD1O00515 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAD1O00515 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAD1O00515 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAD1O00515 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LAD1O00515 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAD1O00515 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAD1O00515 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAD1O00515 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAD1O00515 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAD1O00515 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAD1O00515 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAD1O00515 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAD1O00515 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAD1O00515 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAD1O00515 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAD1O00515 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms