Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARID3CA6NKF2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms