Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDB3Q6NSJ2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHLDB3Q6NSJ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms