Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms