Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBSP08397 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBSP08397 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBSP08397 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBSP08397 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBSP08397 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBSP08397 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBSP08397 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBSP08397 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBSP08397 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBSP08397 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBSP08397 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBSP08397 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBSP08397 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBSP08397 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBSP08397 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBSP08397 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBSP08397 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMBSP08397 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMBSP08397 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMBSP08397 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMBSP08397 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMBSP08397 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMBSP08397 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMBSP08397 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HMBSP08397 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBSP08397 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBSP08397 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBSP08397 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBSP08397 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBSP08397 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBSP08397 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms