Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
DTX4Q9Y2E6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX4Q9Y2E6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DTX4Q9Y2E6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DTX4Q9Y2E6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DTX4Q9Y2E6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DTX4Q9Y2E6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DTX4Q9Y2E6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DTX4Q9Y2E6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DTX4Q9Y2E6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
DTX4Q9Y2E6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DTX4Q9Y2E6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DTX4Q9Y2E6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DTX4Q9Y2E6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms