Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0B6

CCDC167, Coiled-coil domain-containing protein 167, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC167Q9P0B6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC167Q9P0B6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms