Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms