Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms