Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGAEP38570 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGAEP38570 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.3 ms