Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN7Q9Y6W3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN7Q9Y6W3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms