Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms