Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms