Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DPPA3Q6W0C5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DPPA3Q6W0C5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DPPA3Q6W0C5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DPPA3Q6W0C5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DPPA3Q6W0C5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DPPA3Q6W0C5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DPPA3Q6W0C5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DPPA3Q6W0C5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DPPA3Q6W0C5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DPPA3Q6W0C5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DPPA3Q6W0C5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DPPA3Q6W0C5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DPPA3Q6W0C5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms