Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI3KQ59H18 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms