Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN3Q16667 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms