Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SS18Q15532 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SS18Q15532 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SS18Q15532 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SS18Q15532 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SS18Q15532 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SS18Q15532 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SS18Q15532 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SS18Q15532 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SS18Q15532 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SS18Q15532 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SS18Q15532 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SS18Q15532 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SS18Q15532 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SS18Q15532 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SS18Q15532 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SS18Q15532 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SS18Q15532 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SS18Q15532 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SS18Q15532 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SS18Q15532 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SS18Q15532 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SS18Q15532 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SS18Q15532 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SS18Q15532 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SS18Q15532 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SS18Q15532 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SS18Q15532 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SS18Q15532 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SS18Q15532 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SS18Q15532 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SS18Q15532 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SS18Q15532 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SS18Q15532 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SS18Q15532 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SS18Q15532 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SS18Q15532 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SS18Q15532 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SS18Q15532 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SS18Q15532 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SS18Q15532 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SS18Q15532 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SS18Q15532 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SS18Q15532 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SS18Q15532 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SS18Q15532 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SS18Q15532 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SS18Q15532 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SS18Q15532 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SS18Q15532 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SS18Q15532 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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