RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.68■■■□□ 2.66
PRKCI-201ENST00000295797 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.59■■■□□ 2.65
PRKCI-201ENST00000295797 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
PRKCI-201ENST00000295797 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.61■■■□□ 2.49
PRKCI-201ENST00000295797 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.84■■■□□ 2.37
PRKCI-201ENST00000295797 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
PRKCI-201ENST00000295797 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.66■■■□□ 2.34
PRKCI-201ENST00000295797 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PRKCI-201ENST00000295797 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PRKCI-201ENST00000295797 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
PRKCI-201ENST00000295797 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
PRKCI-201ENST00000295797 MYT1Q01538 1121 aa28.72■■■□□ 2.19
PRKCI-201ENST00000295797 APLP2Q06481 763 aa28.68■■■□□ 2.18
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM41Q8WV44 630 aa28.64■■■□□ 2.18
PRKCI-201ENST00000295797 HRCP23327 699 aa28.61■■■□□ 2.17
PRKCI-201ENST00000295797 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.16
PRKCI-201ENST00000295797 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.52■■■□□ 2.16
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PRKCI-201ENST00000295797 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PRKCI-201ENST00000295797 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.26■■■□□ 2.11
PRKCI-201ENST00000295797 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PRKCI-201ENST00000295797 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.24■■■□□ 2.11
PRKCI-201ENST00000295797 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PRKCI-201ENST00000295797 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
PRKCI-201ENST00000295797 NEFLP07196 543 aa27.95■■■□□ 2.06
PRKCI-201ENST00000295797 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
PRKCI-201ENST00000295797 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PRKCI-201ENST00000295797 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
PRKCI-201ENST00000295797 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
PRKCI-201ENST00000295797 ITGAEP38570 1179 aa27.25■■□□□ 1.95
PRKCI-201ENST00000295797 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.11■■□□□ 1.93
PRKCI-201ENST00000295797 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PRKCI-201ENST00000295797 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PRKCI-201ENST00000295797 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PRKCI-201ENST00000295797 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.71■■□□□ 1.87
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PRKCI-201ENST00000295797 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PRKCI-201ENST00000295797 BCANQ96GW7 911 aa26.64■■□□□ 1.86
PRKCI-201ENST00000295797 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.59■■□□□ 1.85
PRKCI-201ENST00000295797 NEUROD1Q13562 356 aa26.49■■□□□ 1.83
PRKCI-201ENST00000295797 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PRKCI-201ENST00000295797 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.44■■□□□ 1.82
PRKCI-201ENST00000295797 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PRKCI-201ENST00000295797 ABCC9O60706 1549 aa26.34■■□□□ 1.81
PRKCI-201ENST00000295797 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.8
PRKCI-201ENST00000295797 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PRKCI-201ENST00000295797 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.31■■□□□ 1.8
PRKCI-201ENST00000295797 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.31■■□□□ 1.8
PRKCI-201ENST00000295797 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PRKCI-201ENST00000295797 ANP32CO43423 234 aa26.24■■□□□ 1.79
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM52Q96A61 297 aa26.17■■□□□ 1.78
PRKCI-201ENST00000295797 MIER1Q8N108 512 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCI-201ENST00000295797 FKBP8Q14318 412 aa25.96■■□□□ 1.75
PRKCI-201ENST00000295797 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.96■■□□□ 1.75
PRKCI-201ENST00000295797 P3H3Q8IVL6 736 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCI-201ENST00000295797 SCRIBQ14160 1630 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PRKCI-201ENST00000295797 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PRKCI-201ENST00000295797 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PRKCI-201ENST00000295797 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PRKCI-201ENST00000295797 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.72■■□□□ 1.71
PRKCI-201ENST00000295797 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
PRKCI-201ENST00000295797 ARID3CA6NKF2 412 aa25.64■■□□□ 1.7
PRKCI-201ENST00000295797 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
PRKCI-201ENST00000295797 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PRKCI-201ENST00000295797 TONSLQ96HA7 1378 aa25.59■■□□□ 1.69
PRKCI-201ENST00000295797 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PRKCI-201ENST00000295797 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.53■■□□□ 1.68
PRKCI-201ENST00000295797 CEP162Q5TB80 1403 aa25.51■■□□□ 1.68
PRKCI-201ENST00000295797 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PRKCI-201ENST00000295797 CLIP1P30622 1438 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKCI-201ENST00000295797 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PRKCI-201ENST00000295797 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PRKCI-201ENST00000295797 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.41■■□□□ 1.66
PRKCI-201ENST00000295797 NBR1Q14596 966 aa25.39■■□□□ 1.66
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PRKCI-201ENST00000295797 FBLN2P98095 1184 aa25.33■■□□□ 1.64
PRKCI-201ENST00000295797 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.32■■□□□ 1.64
PRKCI-201ENST00000295797 BCL11AQ9H165 835 aa25.3■■□□□ 1.64
PRKCI-201ENST00000295797 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PRKCI-201ENST00000295797 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PRKCI-201ENST00000295797 GOLGA3Q08378 1498 aa25.27■■□□□ 1.64
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.27■■□□□ 1.64
PRKCI-201ENST00000295797 MRS2Q9HD23 443 aa25.27■■□□□ 1.64
PRKCI-201ENST00000295797 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.24■■□□□ 1.63
PRKCI-201ENST00000295797 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.23■■□□□ 1.63
PRKCI-201ENST00000295797 EEA1Q15075 1411 aa25.21■■□□□ 1.63
PRKCI-201ENST00000295797 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PRKCI-201ENST00000295797 TMC1Q8TDI8 760 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKCI-201ENST00000295797 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PRKCI-201ENST00000295797 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PRKCI-201ENST00000295797 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
PRKCI-201ENST00000295797 NEFMP07197 916 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKCI-201ENST00000295797 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.06■■□□□ 1.6
PRKCI-201ENST00000295797 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.06■■□□□ 1.6
PRKCI-201ENST00000295797 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
PRKCI-201ENST00000295797 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.04■■□□□ 1.6
PRKCI-201ENST00000295797 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.02■■□□□ 1.6
PRKCI-201ENST00000295797 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms