RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.94■■■□□ 2.54
AMIGO1-202ENST00000369864 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.49■■■□□ 2.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
AMIGO1-202ENST00000369864 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
AMIGO1-202ENST00000369864 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.44■■■□□ 2.3
AMIGO1-202ENST00000369864 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.23■■■□□ 2.27
AMIGO1-202ENST00000369864 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.21■■■□□ 2.27
AMIGO1-202ENST00000369864 MYT1Q01538 1121 aa28.96■■■□□ 2.23
AMIGO1-202ENST00000369864 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
AMIGO1-202ENST00000369864 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
AMIGO1-202ENST00000369864 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.63■■■□□ 2.17
AMIGO1-202ENST00000369864 APLP2Q06481 763 aa28.61■■■□□ 2.17
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
AMIGO1-202ENST00000369864 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
AMIGO1-202ENST00000369864 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
AMIGO1-202ENST00000369864 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
AMIGO1-202ENST00000369864 HRCP23327 699 aa28.12■■■□□ 2.09
AMIGO1-202ENST00000369864 NEFLP07196 543 aa28■■■□□ 2.07
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AMIGO1-202ENST00000369864 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
AMIGO1-202ENST00000369864 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
AMIGO1-202ENST00000369864 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
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AMIGO1-202ENST00000369864 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.16■■□□□ 1.94
AMIGO1-202ENST00000369864 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
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AMIGO1-202ENST00000369864 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.08■■□□□ 1.93
AMIGO1-202ENST00000369864 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.97■■□□□ 1.91
AMIGO1-202ENST00000369864 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-202ENST00000369864 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
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AMIGO1-202ENST00000369864 ITGAEP38570 1179 aa26.77■■□□□ 1.88
AMIGO1-202ENST00000369864 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.65■■□□□ 1.86
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AMIGO1-202ENST00000369864 BCANQ96GW7 911 aa26.59■■□□□ 1.85
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
AMIGO1-202ENST00000369864 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
AMIGO1-202ENST00000369864 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
AMIGO1-202ENST00000369864 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.33■■□□□ 1.81
AMIGO1-202ENST00000369864 ANP32CO43423 234 aa26.13■■□□□ 1.77
AMIGO1-202ENST00000369864 NEUROD1Q13562 356 aa26.04■■□□□ 1.76
AMIGO1-202ENST00000369864 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
AMIGO1-202ENST00000369864 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
AMIGO1-202ENST00000369864 FKBP8Q14318 412 aa25.83■■□□□ 1.73
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCC9O60706 1549 aa25.82■■□□□ 1.72
AMIGO1-202ENST00000369864 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.8■■□□□ 1.72
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
AMIGO1-202ENST00000369864 TRIM52Q96A61 297 aa25.79■■□□□ 1.72
AMIGO1-202ENST00000369864 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
AMIGO1-202ENST00000369864 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-202ENST00000369864 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.57■■□□□ 1.68
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AMIGO1-202ENST00000369864 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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AMIGO1-202ENST00000369864 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
AMIGO1-202ENST00000369864 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.37■■□□□ 1.65
AMIGO1-202ENST00000369864 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.37■■□□□ 1.65
AMIGO1-202ENST00000369864 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
AMIGO1-202ENST00000369864 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
AMIGO1-202ENST00000369864 BCL11AQ9H165 835 aa25.3■■□□□ 1.64
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.27■■□□□ 1.64
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.24■■□□□ 1.63
AMIGO1-202ENST00000369864 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
AMIGO1-202ENST00000369864 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
AMIGO1-202ENST00000369864 TONSLQ96HA7 1378 aa25.15■■□□□ 1.62
AMIGO1-202ENST00000369864 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
AMIGO1-202ENST00000369864 P3H3Q8IVL6 736 aa25.1■■□□□ 1.61
AMIGO1-202ENST00000369864 ARXQ96QS3 562 aa25.08■■□□□ 1.61
AMIGO1-202ENST00000369864 SCRIBQ14160 1630 aa25.07■■□□□ 1.6
AMIGO1-202ENST00000369864 NEFMP07197 916 aa25.02■■□□□ 1.6
AMIGO1-202ENST00000369864 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
AMIGO1-202ENST00000369864 MRS2Q9HD23 443 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-202ENST00000369864 TMC1Q8TDI8 760 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-202ENST00000369864 ARID3CA6NKF2 412 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
AMIGO1-202ENST00000369864 FBLN2P98095 1184 aa24.88■■□□□ 1.57
AMIGO1-202ENST00000369864 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.87■■□□□ 1.57
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC24A1O60721 1099 aa24.86■■□□□ 1.57
AMIGO1-202ENST00000369864 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.84■■□□□ 1.57
AMIGO1-202ENST00000369864 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
AMIGO1-202ENST00000369864 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
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AMIGO1-202ENST00000369864 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-202ENST00000369864 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.71■■□□□ 1.55
AMIGO1-202ENST00000369864 BECN1Q14457 450 aa24.7■■□□□ 1.54
AMIGO1-202ENST00000369864 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
AMIGO1-202ENST00000369864 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
AMIGO1-202ENST00000369864 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
AMIGO1-202ENST00000369864 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.62■■□□□ 1.53
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
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