Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHA9Q7RTU4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms