Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LRRC9Q6ZRR7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms