Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME3Q16798 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME3Q16798 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME3Q16798 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME3Q16798 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME3Q16798 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ME3Q16798 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME3Q16798 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME3Q16798 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME3Q16798 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME3Q16798 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ME3Q16798 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ME3Q16798 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME3Q16798 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME3Q16798 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME3Q16798 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME3Q16798 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ME3Q16798 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME3Q16798 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME3Q16798 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME3Q16798 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME3Q16798 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME3Q16798 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME3Q16798 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ME3Q16798 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ME3Q16798 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME3Q16798 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME3Q16798 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME3Q16798 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME3Q16798 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME3Q16798 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ME3Q16798 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME3Q16798 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME3Q16798 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ME3Q16798 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME3Q16798 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME3Q16798 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME3Q16798 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME3Q16798 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME3Q16798 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME3Q16798 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ME3Q16798 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME3Q16798 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME3Q16798 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME3Q16798 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME3Q16798 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME3Q16798 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME3Q16798 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME3Q16798 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME3Q16798 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME3Q16798 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ME3Q16798 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME3Q16798 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME3Q16798 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME3Q16798 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME3Q16798 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME3Q16798 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME3Q16798 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME3Q16798 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME3Q16798 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME3Q16798 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME3Q16798 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME3Q16798 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ME3Q16798 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME3Q16798 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME3Q16798 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ME3Q16798 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME3Q16798 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME3Q16798 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME3Q16798 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME3Q16798 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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