Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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