Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 RIM1YCR028C-A 408 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 TRX2YGR209C 315 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YPT7YML001W 627 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YPR197CYPR197C 564 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 SEC66YBR171W 621 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 JEM1YJL073W 1938 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 SLF1YDR515W 1344 nt5.21□□□□□ -1.58 RIP-Chip
PUF3Q07807 RPL35BYDL136W 363 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YER046W-AYER046W-A 330 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 RPL28YGL103W 450 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 FYV4YHR059W 393 nt5.2□□□□□ -1.58 RIP-Chip
PUF3Q07807 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YLR287CYLR287C 1068 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YML047W-AYML047W-A 366 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 UBX4YMR067C 1251 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 HLJ1YMR161W 675 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 ATG8YBL078C 354 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 QCR2YPR191W 1107 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 OPY1YBR129C 987 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 STE20YHL007C 2820 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YDR444WYDR444W 2064 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 UBX7YBR273C 1311 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 SAS10YDL153C 1833 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 PES4YFR023W 1836 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 GUK1YDR454C 564 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 Q0092Q0092 141 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 CAX4YGR036C 720 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 PET54YGR222W 882 nt5.19□□□□□ -1.58 RIP-Chip
PUF3Q07807 RPS20YHL015W 366 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 BUD28YLR062C 378 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YNL109WYNL109W 546 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 ZPS1YOL154W 750 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 DSS4YPR017C 432 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 BMT2YBR141C 1014 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 PBN1YCL052C 1251 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 ASA1YPR085C 1332 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 FAP1YNL023C 2898 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 DBF4YDR052C 2115 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YML020WYML020W 1995 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 RRB1YMR131C 1536 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 OCA5YHL029C 2040 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YCR064CYCR064C 411 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 NUS1YDL193W 1128 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 DAD1YDR016C 285 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 UBC1YDR177W 648 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 HUR1YGL168W 333 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 GAT4YIR013C 366 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 ROX1YPR065W 1107 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 APL6YGR261C 2430 nt5.18□□□□□ -1.58 RIP-Chip
PUF3Q07807 EMP46YLR080W 1335 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 STE7YDL159W 1548 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 CHK1YBR274W 1584 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 SEC9YGR009C 1956 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 CWC2YDL209C 1020 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 FIN1YDR130C 876 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YER079WYER079W 633 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 TOS8YGL096W 831 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YKE4YIL023C 1041 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YLR346CYLR346C 306 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YMR254CYMR254C 309 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 SIW14YNL032W 846 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 RBL2YOR265W 321 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YOR282WYOR282W 321 nt5.17□□□□□ -1.58 RIP-Chip
PUF3Q07807 TOM5YPR133W-A 153 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 ORC6YHR118C 1308 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 ATH1YPR026W 3636 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 SUC2YIL162W 1599 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 GZF3YJL110C 1656 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 UGA2YBR006W 1494 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YER087C-AYER087C-A 552 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 SPO13YHR014W 876 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YHR138CYHR138C 345 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 RPL16AYIL133C 600 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 PRM10YJL108C 1152 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 SOP4YJL192C 705 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YJR037WYJR037W 384 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 UBI4YLL039C 1146 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 ERG3YLR056W 1098 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 ATP14YLR295C 375 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 IMP2YMR035W 534 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 RRN9YMR270C 1098 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 SFM1YOR021C 642 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 PEP12YOR036W 867 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 RMI1YPL024W 726 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YPL088WYPL088W 1029 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 SUA7YPR086W 1038 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 DNF2YDR093W 4839 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 BDP1YNL039W 1785 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 FPK1YNR047W 2682 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 GCN20YFR009W 2259 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 ARN1YHL040C 1884 nt5.15□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 MSA1YOR066W 1890 nt5.15□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YPT35YHR105W 645 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YVH1YIR026C 1095 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YKL131WYKL131W 522 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YNL043CYNL043C 321 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF3Q07807 YNL337WYNL337W 255 nt5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.4 ms