Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IP78347 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IP78347 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2IP78347 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms