Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHKA1P46020 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHKA1P46020 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms