Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5A1P25705 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms