Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LIPT2A6NK58 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIPT2A6NK58 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms