Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BHLHE23Q8NDY6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE23Q8NDY6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms