Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYNE4Q8N205 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNE4Q8N205 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms