Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC30Q5VVM6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC30Q5VVM6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC30Q5VVM6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC30Q5VVM6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms