Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A2Q12974 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A2Q12974 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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