Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms