Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDE1BQ01064 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1BQ01064 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms