Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1P21675 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1P21675 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1P21675 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1P21675 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1P21675 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1P21675 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1P21675 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1P21675 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1P21675 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1P21675 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1P21675 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1P21675 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1P21675 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TAF1P21675 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TAF1P21675 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TAF1P21675 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TAF1P21675 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1P21675 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1P21675 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1P21675 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1P21675 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1P21675 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1P21675 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1P21675 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1P21675 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1P21675 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1P21675 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1P21675 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1P21675 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1P21675 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1P21675 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1P21675 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1P21675 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1P21675 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1P21675 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1P21675 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1P21675 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1P21675 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1P21675 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1P21675 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1P21675 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1P21675 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1P21675 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1P21675 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1P21675 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1P21675 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1P21675 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1P21675 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1P21675 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1P21675 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1P21675 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF1P21675 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF1P21675 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF1P21675 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF1P21675 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF1P21675 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF1P21675 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF1P21675 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF1P21675 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF1P21675 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1P21675 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1P21675 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1P21675 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1P21675 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1P21675 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1P21675 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1P21675 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1P21675 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1P21675 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1P21675 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1P21675 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1P21675 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms