Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4BP3O15049 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms