Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPACA6W5XKT8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPACA6W5XKT8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms