Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPACA6W5XKT8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPACA6W5XKT8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPACA6W5XKT8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPACA6W5XKT8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPACA6W5XKT8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPACA6W5XKT8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPACA6W5XKT8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPACA6W5XKT8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPACA6W5XKT8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms