Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQ87 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQ87 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQ87 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U3KQ87 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U3KQ87 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U3KQ87 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U3KQ87 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQ87 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
U3KQ87 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQ87 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQ87 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQ87 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U3KQ87 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U3KQ87 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U3KQ87 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U3KQ87 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U3KQ87 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U3KQ87 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U3KQ87 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQ87 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQ87 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQ87 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQ87 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U3KQ87 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U3KQ87 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U3KQ87 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U3KQ87 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQ87 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQ87 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQ87 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQ87 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQ87 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQ87 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQ87 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQ87 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQ87 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQ87 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQ87 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQ87 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQ87 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQ87 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U3KQ87 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U3KQ87 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U3KQ87 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U3KQ87 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U3KQ87 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U3KQ87 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQ87 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQ87 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQ87 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQ87 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQ87 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQ87 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQ87 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQ87 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQ87 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U3KQ87 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQ87 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQ87 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQ87 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U3KQ87 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KQ87 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U3KQ87 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQ87 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQ87 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQ87 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U3KQ87 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQ87 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQ87 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U3KQ87 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQ87 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQ87 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U3KQ87 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U3KQ87 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQ87 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQ87 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U3KQ87 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U3KQ87 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U3KQ87 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQ87 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KQ87 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQ87 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQ87 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KQ87 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQ87 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQ87 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQ87 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQ87 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQ87 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQ87 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQ87 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQ87 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQ87 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQ87 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQ87 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQ87 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQ87 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQ87 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQ87 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms