Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX6Q9UPM6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LHX6Q9UPM6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX6Q9UPM6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LHX6Q9UPM6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LHX6Q9UPM6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LHX6Q9UPM6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LHX6Q9UPM6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX6Q9UPM6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX6Q9UPM6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX6Q9UPM6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX6Q9UPM6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX6Q9UPM6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX6Q9UPM6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX6Q9UPM6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX6Q9UPM6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX6Q9UPM6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX6Q9UPM6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX6Q9UPM6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX6Q9UPM6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX6Q9UPM6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX6Q9UPM6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX6Q9UPM6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX6Q9UPM6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX6Q9UPM6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX6Q9UPM6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX6Q9UPM6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX6Q9UPM6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX6Q9UPM6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX6Q9UPM6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX6Q9UPM6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX6Q9UPM6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX6Q9UPM6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX6Q9UPM6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX6Q9UPM6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX6Q9UPM6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX6Q9UPM6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX6Q9UPM6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LHX6Q9UPM6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LHX6Q9UPM6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LHX6Q9UPM6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LHX6Q9UPM6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LHX6Q9UPM6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX6Q9UPM6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LHX6Q9UPM6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX6Q9UPM6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX6Q9UPM6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX6Q9UPM6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LHX6Q9UPM6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LHX6Q9UPM6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX6Q9UPM6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LHX6Q9UPM6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LHX6Q9UPM6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX6Q9UPM6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX6Q9UPM6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX6Q9UPM6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.2 ms