Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCDHA12Q9UN75 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCDHA12Q9UN75 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCDHA12Q9UN75 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PCDHA12Q9UN75 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PCDHA12Q9UN75 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PCDHA12Q9UN75 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PCDHA12Q9UN75 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PCDHA12Q9UN75 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PCDHA12Q9UN75 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PCDHA12Q9UN75 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PCDHA12Q9UN75 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PCDHA12Q9UN75 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PCDHA12Q9UN75 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PCDHA12Q9UN75 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PCDHA12Q9UN75 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PCDHA12Q9UN75 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PCDHA12Q9UN75 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PCDHA12Q9UN75 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PCDHA12Q9UN75 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PCDHA12Q9UN75 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PCDHA12Q9UN75 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PCDHA12Q9UN75 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PCDHA12Q9UN75 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PCDHA12Q9UN75 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PCDHA12Q9UN75 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PCDHA12Q9UN75 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PCDHA12Q9UN75 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PCDHA12Q9UN75 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PCDHA12Q9UN75 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PCDHA12Q9UN75 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PCDHA12Q9UN75 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PCDHA12Q9UN75 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PCDHA12Q9UN75 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PCDHA12Q9UN75 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PCDHA12Q9UN75 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PCDHA12Q9UN75 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCDHA12Q9UN75 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCDHA12Q9UN75 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCDHA12Q9UN75 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCDHA12Q9UN75 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PCDHA12Q9UN75 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCDHA12Q9UN75 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCDHA12Q9UN75 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCDHA12Q9UN75 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCDHA12Q9UN75 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCDHA12Q9UN75 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCDHA12Q9UN75 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCDHA12Q9UN75 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCDHA12Q9UN75 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCDHA12Q9UN75 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PCDHA12Q9UN75 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PCDHA12Q9UN75 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PCDHA12Q9UN75 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PCDHA12Q9UN75 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PCDHA12Q9UN75 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PCDHA12Q9UN75 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PCDHA12Q9UN75 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PCDHA12Q9UN75 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCDHA12Q9UN75 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms