Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM21

MGAT4A, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4AQ9UM21 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGAT4AQ9UM21 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGAT4AQ9UM21 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGAT4AQ9UM21 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGAT4AQ9UM21 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGAT4AQ9UM21 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGAT4AQ9UM21 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGAT4AQ9UM21 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGAT4AQ9UM21 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGAT4AQ9UM21 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGAT4AQ9UM21 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGAT4AQ9UM21 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGAT4AQ9UM21 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGAT4AQ9UM21 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MGAT4AQ9UM21 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGAT4AQ9UM21 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MGAT4AQ9UM21 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms