Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1BQ9P298 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1BQ9P298 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1BQ9P298 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1BQ9P298 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1BQ9P298 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1BQ9P298 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIGD1BQ9P298 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIGD1BQ9P298 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HIGD1BQ9P298 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIGD1BQ9P298 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIGD1BQ9P298 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIGD1BQ9P298 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIGD1BQ9P298 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIGD1BQ9P298 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIGD1BQ9P298 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIGD1BQ9P298 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIGD1BQ9P298 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIGD1BQ9P298 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIGD1BQ9P298 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIGD1BQ9P298 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HIGD1BQ9P298 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIGD1BQ9P298 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIGD1BQ9P298 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIGD1BQ9P298 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIGD1BQ9P298 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIGD1BQ9P298 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIGD1BQ9P298 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIGD1BQ9P298 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIGD1BQ9P298 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIGD1BQ9P298 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIGD1BQ9P298 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HIGD1BQ9P298 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIGD1BQ9P298 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms