Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH8Q9NYR8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH8Q9NYR8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDH8Q9NYR8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDH8Q9NYR8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH8Q9NYR8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDH8Q9NYR8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH8Q9NYR8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH8Q9NYR8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH8Q9NYR8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH8Q9NYR8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH8Q9NYR8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH8Q9NYR8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH8Q9NYR8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH8Q9NYR8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH8Q9NYR8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH8Q9NYR8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH8Q9NYR8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH8Q9NYR8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms