Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DLL3Q9NYJ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DLL3Q9NYJ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DLL3Q9NYJ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DLL3Q9NYJ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DLL3Q9NYJ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DLL3Q9NYJ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DLL3Q9NYJ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DLL3Q9NYJ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DLL3Q9NYJ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DLL3Q9NYJ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DLL3Q9NYJ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DLL3Q9NYJ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DLL3Q9NYJ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DLL3Q9NYJ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DLL3Q9NYJ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DLL3Q9NYJ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DLL3Q9NYJ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms