Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVK5

FGFR1OP2, FGFR1 oncogene partner 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1OP2Q9NVK5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGFR1OP2Q9NVK5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGFR1OP2Q9NVK5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR1OP2Q9NVK5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGFR1OP2Q9NVK5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGFR1OP2Q9NVK5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGFR1OP2Q9NVK5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGFR1OP2Q9NVK5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGFR1OP2Q9NVK5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGFR1OP2Q9NVK5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGFR1OP2Q9NVK5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGFR1OP2Q9NVK5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FGFR1OP2Q9NVK5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FGFR1OP2Q9NVK5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR1OP2Q9NVK5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGFR1OP2Q9NVK5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR1OP2Q9NVK5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR1OP2Q9NVK5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR1OP2Q9NVK5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FGFR1OP2Q9NVK5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FGFR1OP2Q9NVK5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FGFR1OP2Q9NVK5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGFR1OP2Q9NVK5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGFR1OP2Q9NVK5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGFR1OP2Q9NVK5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGFR1OP2Q9NVK5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGFR1OP2Q9NVK5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGFR1OP2Q9NVK5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGFR1OP2Q9NVK5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGFR1OP2Q9NVK5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FGFR1OP2Q9NVK5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FGFR1OP2Q9NVK5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGFR1OP2Q9NVK5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FGFR1OP2Q9NVK5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGFR1OP2Q9NVK5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGFR1OP2Q9NVK5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGFR1OP2Q9NVK5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGFR1OP2Q9NVK5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGFR1OP2Q9NVK5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGFR1OP2Q9NVK5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGFR1OP2Q9NVK5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGFR1OP2Q9NVK5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGFR1OP2Q9NVK5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGFR1OP2Q9NVK5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGFR1OP2Q9NVK5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGFR1OP2Q9NVK5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR1OP2Q9NVK5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGFR1OP2Q9NVK5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGFR1OP2Q9NVK5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGFR1OP2Q9NVK5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGFR1OP2Q9NVK5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGFR1OP2Q9NVK5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGFR1OP2Q9NVK5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGFR1OP2Q9NVK5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGFR1OP2Q9NVK5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGFR1OP2Q9NVK5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms